Ähnlich wie im PSP-Ableger „Metal Gear Solid: Peace Walker“ können die Spieler ihre eigene Basis aufbauen und dementsprechend verwalten.
Während der „Eurogamer Expo“ erklärt der Serienschöpfer Hideo Kojima, dass Snake nicht nur von außen eine Entwicklung vornehmen, sondern auch auf den Stützpunkt landen und es darüber hinaus erkunden kann.
Snake hat die Möglichkeit neues Personal zu rekrutieren, Ressourcen auszubauen und mit dem Helikopter weit entfernte Gebiete erreichen.
Während des Einsatzes kann die Kommunikation mit einem Smartphone aufgebaut und weitere Änderungen auf der Basis vorgenommen werden.
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